В настоящее время хорошо известно, что нормальная бактериальная флора различных локусов макроорганизма препятствует инвазии в них патогенных микроорганизмов. Любая инвазия в здоровый эпителий практически всегда со­провождается изменением состава микрофлоры. Как воспалительные заболе­вания женских половых путей, так и болезни, передаваемые половым путем, сопровождаются подобными изменениями микробного пейзажа влагалища.   

После наступления менопаузы микрофлора характеризуется снижением уровня колонизации влагалища лактобактериями, что связано с уменьшением концентрации эстрогенов и, следовательно, со снижением содержания гликоге­на в эпителиальных клетках и повышением рН влагалищного содержимого. Среди микроорганизмов преобладают колиформы и дифтероиды. Кроме того, обнаружены изменения качественного и количественного состава бактериаль­ных видов в пре-и менопаузальный период.

У новорожденных девочек стерильное влагалище через 12-20 часов колони­зируется анаэробными и факультативно-анаэробными микроорганизмами. 

В свою очередь влагалищная микрофлора является одним из звеньев меха­низма, регулирующего гомеостаз влагалища путем подавления патогенных ми­кроорганизмов.

Микрофлора влагалища здоровых женщин репродуктивного возраста может быть представлена:

Микроаэрофильными бактериями: Lactobacillus spp., L.fermentum, Lcrispa-tus, Ljensenii, L.gasseri, L.acidophilus, L.plantarum, L.brevis, L.delbruckii, L.sali-varius, G. Vaginalis.

Облигатно-анаэробными грамположительными бактериями: Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., B.bifidum.

Облигатно-анаэробными грамотрицательными бактериями: Bacteroides spp., B.utealyticum, B.fragilis, B.vulgatus

Факультативно-анаэробными грамположительными бактериями: Corynebacterium spp., C.aquatum, C.minutissium, C.equi, C.xerosis, C.bovis, C.enzymicum, C.kutsheri, Staphylococcus spp.

Дрожжеподобными грибами рода Candida: C.albicans, C.tropicalis, Torulopsis glabrata.

В то же время, на современном этапе, около 400 видов бактерий и 150 виру­сов могут быть идентифицированы у человека, не имеющего никаких призна­ков болезни. Следовательно, выделение того или иного возбудителя не всегда является основанием для постановки диагноза инфекционного процесса. Ре­шающую роль в возникновении инфекционного процесса играют состояние ми­кроорганизма, массивность инфицирования и вирулентность микробного аген­та.

Состояние и функция верхних отделов репродуктивного тракта во многом за­висит от механизмов защиты влагалища:

•   Физиологические бели - в норме 1-2 мл/сут.

•   Физиологическая десквамация эпителия (вместе с ним выводятся и бакте­рии)

•   Микрофлора влагалища (за счет конкурирования с патагентами за питатель­ные вещества)

•   Доминирование лактобактерий

•   Создание кислой среды, рН влагалищного содержимого в пределах 4-4,5

•   Стимуляция иммунной системы

•   Секреторные иммуноглобулины, система комплимента

•  Лизоцим слизистой, лизин (выделяется тромбоцитами в очаге воспаления).
Бактерицидная слизистая пробка цервикального канала обеспечивает механическую преграду за счет вязкости, а также содержит антимикробные субстанции и антитела (секреторный lg А, лизоцим).

На сегодняшний день описано значительное число эндогенных факторов, способствующих нарушению микроциноза влагалища, одним из проявлений которого является бактериальный вагиноз.